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如果在注册12306账号时发现手机号被占用，可能是由于以下几种情况导致的。
1、您的手机号码可能之前已经被注册过，在这种情况下，可以尝试找回密码或者联系客服来找回账号。
2、您的手机号码可能被误输入或者误注册了，在这种情况下，可以尝试联系相关机构或者客服，请求他们删除或者更正相关信息。
3、也有可能是您的个人信息被泄露了，有人用您的手机号注册了账号，如果是这种情况，建议立即更改密码，并加强账户安全，如绑定邮箱、设置密保问题等，也需要提高警惕，注意个人信息保护。
如果无法解决问题，可以联系12306的客服或者相关机构寻求帮助，他们可能会要求您提供一些信息来验证您的身份，然后协助您解决问题，也可以尝试使用其他手机号注册账号。
无论哪种情况，建议都要加强账户安全，设置复杂的密码，并避免使用简单的、容易被猜到的密码，也要避免在公共场合或者不安全的网络环境下使用账号，以降低账户被盗或者信息被泄露的风险。